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viral_seq 1.0.0

A Ruby Gem with bioinformatics tools for processing viral NGS data. Specifically for Primer-ID sequencing and HIV drug resistance analysis.

Gemfile:
=

instalar:
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Versiones:

  1. 1.8.1.1 June 04, 2024 (3,59 MB)
  2. 1.8.0 May 10, 2024 (3,59 MB)
  3. 1.7.1 May 12, 2023 (3,54 MB)
  4. 1.7.0 August 25, 2022 (3,53 MB)
  5. 1.6.4 July 19, 2022 (7,05 MB)
  6. 1.0.0 July 09, 2019 (41 KB)
Mostrar todas las versiones (49 total)

dependencias de Runtime (1):

muscle_bio ~> 0.4

dependencias de Development (3):

bundler ~> 2.0
rake ~> 10.0
rspec ~> 3.0

Requerimientos:

MUSCLE (http://www.drive5.com/muscle) required for some functions

R required for some functions

Propietarios:

Subida por:

Autores:

  • Shuntai Zhou, Michael Clark

SHA 256 checksum:

=

Total de descargas 59.121

Para esta versión 1.808

Versión publicada:

Licencia:

MIT

Versión de Ruby requerida: >= 0

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